Objetivos e Competências
Esta Unidade Curricular pretende oferecer uma perspectiva geral e actual de diferentes abordagens moleculares utilizadas em Microbiologia. Ao percorrer diferentes metodologias e áreas de aplicação, procura-se ainda que os alunos integrem as vertentes convencional e molecular no estudo de microrganismos e que desenvolvam as suas capacidades de análise crítica de informação científica nesta área.
Competência a adquirir
Identificação do potencial uso, aplicações e limitações, de diferentes abordagens metodológicas, mediante os resultados ou conclusões pretendidos.
Capacidade para pesquisar e analisar informação relevante e actual no contexto da disciplina da Microbiologia, designadamente em abordagens moleculares.
Desenvolvimento da capacidade para apresentar e discutir dados e informação diversa no contexto da Microbiologia Molecular e dos seus inúmeros campos de aplicação.
Metodologias de ensino
A unidade curricular envolve diferentes componentes:
Aulas T (4h) – Temas de base e introdução sobre Microbiologia Molecular - leccionadas de forma expositiva
Aulas PL (laboratório + bioinformática) (8h) – exercícios a realizados pelos alunos
Seminários (4h) – Palestras proferidas por investigadores convidados
Journal club (6h) – Análise e discussão de artigos científicos
Visita de estudo (4h) – Visita a um centro de investigação e de incubação de empresas (BIOCANT)
Métodos e Critérios de Avaliação:
Artigo científico – Apresentação e capacidade para promover a discussão – 30 %
Quizz – testes de resposta rápida (máximo 10 questões) sobre o artigo discutido na aula – 15 %
Resumo seminário – 180 palavras sobre cada seminário – apreciação crítica da técnica/abordagem referida – 10 %
Nota Visita estudo – 100 palavras no formato de nota de imprensa sobre o BIOCANT – 5 %
Relatório das aulas PL – relatório com um máximo de 2500 palavras, em formato de nota científica – 15 %
Projecto final – proposta de uma abordagem de investigação na resolução de um problema concreto, máximo de 1000 palavras e 5 páginas; inclusão obrigatória de: um plano de acção com indicação do plano temporal, avaliação de pontos fortes e de pontos fracos (tempo de resolução 48 horas) – 25 %
Conteúdos
AULAS TEÓRICAS
Comunidades microbianas
Sequenciação de genomas completos
Mecanismos de patogenicidade
Controlo e regulação da expressão génica
Epidemiologia Molecular
AULAS PRÁTICAS
Análise por multi-locus sequence typing de linhagens bacterianas com origem em diferentes locais;
Pesquisa de mutações génicas, responsáveis por alterações de fenótipo (caso de resistência a quinolonas)
ORIENTAÇÃO TUTORIAL
Pesquisa de artigos de revisão ou de investigação publicados em revistas internacionais com arbitragem e com datas posteriores a 2005 (inclusivé). Cada grupo de dois alunos envia três propostas. A equipa docente selecciona um por grupo. O grupo estuda o artigo, apresenta-o e suscita discussão com os colegas (que também leram o mesmo artigo). No final de cada sessão há um quizz individual sobre o artigo analisado anteriormente.
Seminários: Gonçalo Almeida (ESB-UCP) – Estudos sobre Listeria spp. Transmitida por via alimentar
Manuela Côrte-Real (BDUM) – Citometria de Fluxo em Microbiologia
Nelson Lima(DEBUM) – Microbiologia convencional e molecular no estudo de fungos filamentosos. Metodologias de ensino
TRABALHO DE CAMPO
Visita de estudo - BIOCANT
