Objetivos e Competências
A unidade curricular compreende o desenvolvimento de um projeto laboratorial acompanhado durante as aulas pelos docentes, onde cada grupo terá o seu tema visando:
Compreensão de diversas técnicas de Microbiologia e de Biologia Molecular
Consolidação de técnicas básicas de Microbiologia e a sua ligação com a Microbiologia Molecular
Desenvolvimento de competências na resolução de problemas e na interpretação de resultados em ambiente laboratorial
Desenvolvimento de autonomia no laboratório
Desenvolvimento da capacidade para planear e executar atividades experimentais
Desenvolvimento da capacidade para compilar, organizar, discutir e integrar resultados experimentais num trabalho escrito;
Desenvolvimento da capacidade para apresentar oralmente, o trabalho realizado.
Metodologias de ensino
A UC é constituída por aulas teórico-práticas, de orientação tutorial e por aulas práticas laboratoriais. Ao longo da UC os alunos ficarão encarregues da aplicação de técnicas no âmbito da UC para a resolução de algo específico-aplicabilidade. Os temas serão escolhidos pelos discentes focando em técnicas mais recentes na área. No final da UC o trabalho é apresentado aos professores e a toda a turma.
As aulas laboratoriais são feitas em grupo, mas conduzidas pelos docentes. É introduzido o conceito do isolamento microbiano a partir de uma matriz, extração do material genético e pesquisa de genes ou proteínas especificas.
Conteúdos programáticos
Preparação de meios de cultura e isolamento de bactérias de uma amostra
Obtenção de culturas puras. Armazenamento/congelação de culturas. Testes bioquímicos e morfológicos
Extração de DNA
Técnica de PCR – amplificação do gene 16S
Eletroforese – preparação de um gel de agarose; aplicação das amostras em gel e visualização do gel
Preparação e envio dos produtos de PCR para sequenciação
Quantificação de DNA genómico e plasmídico
Bioinformática básica para contacto com ferramentas que permitam tratar os resultados de sequenciação para identificação da espécie. BLAST. Análise de fragmentos.
Transformação: Preparação de células competentes, inserção do plasmídeo e confirmação
Orientação Tutorial – Apresentação de técnicas pelos diferentes grupos e aplicações das mesmas com base em artigos científicos a pesquisar.
Teórico-Práticas- Fundamentos teóricos de apoio às aulas práticas. Abordagem sistemática das técnicas microbiológicas e de Biologia Molecular. Fundamentos de bioinformática.